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Permisos, incapacidades y licencias: cómo registrarlos correctamente en marqueme

Guía completa sobre el módulo de novedades de marqueme: permisos remunerados, EPS, licencias de maternidad y paternidad.

7 min de lectura 13 Ago 2026 Equipo L²POS

Las novedades laborales: permisos, incapacidades y licencias, tienen un impacto directo en el cálculo de nómina. Registrarlas incorrectamente genera pagos erróneos, disputas con empleados y problemas ante inspecciones del Ministerio de Trabajo. El módulo de novedades de marqueme centraliza todo esto y lo refleja automáticamente en el período de nómina correspondiente.

Tipos de novedades en marqueme

Marqueme clasifica las novedades en tres grandes categorías:

TipoEjemplosImpacto en nómina
PermisoCon goce de sueldo, Sin goce de sueldoRemunerado o descuento según subtipo
IncapacidadEPS, ARLPago parcial según días y entidad
LicenciaMaternidad, Paternidad, Luto, Calamidad domésticaRemunerada según ley o acuerdo

Permisos remunerados y no remunerados

En marqueme los permisos se clasifican en dos subtipos: Con goce de sueldo, donde el empleado se ausenta pero el empleador le paga igual, y Sin goce de sueldo, donde los días no trabajados se descuentan proporcionalmente del salario.

Al registrar la novedad seleccionas el subtipo, las fechas de inicio y fin, y una descripción del motivo. El sistema calcula automáticamente el impacto en nómina según el subtipo elegido.

Recuerda: Por ley, el empleador debe conceder permiso remunerado para citas médicas del empleado o de menores a su cargo. Registrarlo en marqueme protege a ambas partes.

Incapacidades por EPS y ARL

Cuando un empleado presenta una incapacidad médica, el pago cambia según el origen:

  • Días 1 y 2: los paga el empleador al 100%.
  • Días 3 en adelante (enfermedad general): los paga la EPS al 66.67% del salario base.
  • Incapacidad por accidente laboral (ARL): la ARL paga desde el día 1 al 100%.

En marqueme registras la incapacidad seleccionando el subtipo (EPS o ARL), de inicio y fin, una descripción y el número de Radicado EPS/ARL como soporte del documento. El sistema aplica el impacto correcto en el cálculo de nómina del período.

Siempre solicita el certificado médico original. marqueme te permite adjuntar observaciones y el número de radicado para tener el soporte documentado.

Licencias de maternidad y paternidad

Marqueme maneja cuatro subtipos de licencia: Maternidad (18 semanas), Paternidad (2 semanas), Luto y Calamidad doméstica. Las licencias de maternidad y paternidad las paga la EPS, el empleador las registra para que la ausencia quede justificada y no genere descuentos adicionales.

Al registrar seleccionas el subtipo, las fechas y una descripción. El sistema excluye esos días del cálculo de horas ordinarias sin generar descuento en nómina.

Cómo registrar una novedad paso a paso

  1. Ve a Novedades → Registro de Novedades en el menú lateral de marqueme.
  2. Haz clic en "+ Nueva Novedad".
  3. Selecciona el empleado en el primer campo.
  4. Elige el Tipo: Permiso, Incapacidad o Licencia.
  5. Selecciona el Subtipo según el tipo elegido — Con/Sin goce de sueldo para permisos; EPS/ARL para incapacidades; Maternidad, Paternidad, Luto o Calamidad doméstica para licencias.
  6. Ingresa la Fecha Inicio y Fecha Fin.
  7. Agrega una Descripción del motivo.
  8. Para incapacidades, ingresa el Radicado EPS/ARL como soporte.
  9. Haz clic en "Guardar". La novedad queda vinculada al empleado y al período de nómina.

Impacto en la nómina

Al generar la nómina del período, marqueme considera automáticamente todas las novedades registradas: descuenta los permisos no remunerados, aplica los días de incapacidad según el tipo y deja las licencias sin descuento. El resumen de nómina muestra el desglose de cada novedad para que puedas verificar el cálculo antes de aprobar el pago.

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